A 21 éves csatár 2016 januárjában szerződött a Partizantól a Benfica B-csapatába, 2017–2018-ban a belga Zulte-Waregemet erősítette kölcsönjátékosként, az előző idényben pedig visszatérve Lisszabonba 28 másodosztályú bajnokin hatszor volt eredményes.
Saponjics az Atlético hatodik nyári igazolása, korábban Joao Félix (Benfica), Felipe és Héctor Herrera (mindkettő FC Porto) is Portugáliából érkezett, míg Marcos Llorente a Real Madridot, a brazil Renan Lodi az Athlético Paranaensét hagyta ott a madridiak hívószavára.