Az 54 éves szakember 2000-ben vette át az akkor még másodosztályú Sevilla irányítását, és egészen 2017-ig vezette az andalúz klubot. Ez idő alatt olyan játékosokat fedezett fel, mint Alberto Moreno, Jesús Navas, Sergio Ramos vagy José Antonio Reyes, nem beszélve az olyan légiósok csapathoz hozataláról, mint Dani Alves, Ivan Rakitic vagy Júlio Baptista.
Monchi 2017-ben az AS Romához távozott, és 2019-ig irányította az olasz klubot, aztán visszatért az andalúz fővárosba, ahonnan négy év elteltével távozik újra.
Monchi irányításával a Sevilla hétszer nyerte meg az Európa-ligát, egyszer az Európai Szuperkupát és a Spanyol Szuperkupát, míg további két alkalommal a Király-kupát is elhódította.
Az európai labdarúgás egyik legnagyobb koponyájának tartott sportvezető Birminghamben együtt dolgozhat Unai Emeryvel – sajtóhírek szerint az angol klub első célpontja a Barcelona sportigazgatója, Mateu Alemany volt, de a katalán szakember végül a maradás mellett döntött, így jött szóba a Sevilla sikerkovácsa.
