A 35 éves játékos felnőttszinten 2008 óta szerepelt a Bayern Münchenben, amelynek színeiben több mint 750 hivatalos mérkőzésen lépett pályára. Thomas Müller az idény végén távozott a bajoroktól, és szerdán vált hivatalossá, hogy az MLS-ben szereplő Vancouver Whitecapsnél folytatja pályafutását.
A kanadai klub tájékoztatása szerint Müller a bajnokság hátralévő részére írt alá, a szerződés azonban opcionálisan meghosszabbítható 2026-ig.
Müller többek között 13 bajnoki címet szerzett a Bayern játékosaként, valamint kétszer megnyerte a Bajnokok Ligáját is. A német válogatottal 2014-ben világbajnoki címet szerzett.