Pardoe a teljes karrierjét a Citynél töltötte, 1962 és 1976 között 380 tétmérkőzésen szerepelt a klub színeiben, tagja volt az 1968-as bajnokcsapatnak, emellett 1969-ben megnyerte a gárdával az FA-kupát, majd egy évvel később a Ligakupát és a Kupagyőztesek Európa-kupáját is – a Ligakupa fináléjában ő szerezte a győztes gólt a West Bromwich Albion ellen 2–1-re megnyert mérkőzésen.
A mai napig a klub legfiatalabb debütálójaként számon tartott – 15 évesen és 314 naposan mutatkozott be 1962 áprilisában a Birmingham ellen – Pardoe 1970-ben lábát törte egy George Besttel való ütközés során, felépülése után nem tudott ismét alapemberré válni a csapatban. Visszavonulását követően edzőként került be a City szakmai stábjába.
Pardoe unokája, Tommy Doyle szintén a Manchester City futballistája, a 18 éves középpályás 2019 októberében, a Southampton ellen 3–1-re megnyert Ligakupa-mérkőzésen mutatkozott be a felnőttcsapatban.