Yobo 2002-ben került az Evertonhoz (az azóta is a menedzseri posztot betöltő David Moyes első igazolása volt), és több mint 200 hivatalos tétmérkőzésen húzta magára a liverpooli együttes mezét. Az elmúlt két évet kölcsönben a Fenerbahcéban töltötte, amellyel bajnok és kupagyőztes is lett.
Az egy hónap múlva 32. születésnapját ünneplő védő hároméves szerződést kötött új csapatával.