Queirozt szeptemberben bocsátotta el a portugál szövetség a vártnál rosszabb világbajnoki szereplés (nem jutott be a csapat a nyolc közé) és az Eb-selejtezők gyenge rajtja (4–4 otthon Ciprussal, 1–0-s vereség Norvégiában) miatt. Queiroz egyébként féléves eltiltását tölti, a portugál doppingellenes szövetség azért büntette meg, mert a nyári vb előtt nem engedte be a szervezet ellenőreit a csapat edzőtáborába.
Manchesterben nagyra értékelik Queiroz munkáját, s bár Ferguson elégedett két jelenlegi segédje, az angol Mike Phelan és a holland René Meulensteen munkájával, lenne helye a tapasztalt, több nyelvet beszélő és roppant aprólékos portugálnak is.
Queiroz először 2002-ben dolgozott az Old Traffordon, egy év után a Real Madrid edzője lett, elbocsátása után 2004-ben visszatért. Négy év után, a szövetségi kapitányi poszt felajánlásakor ismét visszatért Ibériába.