Morais tíz alkalommal kapott szerepet a portugál válogatottban 1966 és 1967 között, tagja volt a vb-bronzérmet szerző együttesnek 1966-ban.
A védőként és támadóként is bevethető Moraisról a magyar szurkolóknak is vannak kellemetlen emlékei: az 1964-es KEK-döntőt ő döntötte el, amikor szögletből érintés nélkül csavart az MTK-s Kovalik Ferenc kapujába. A Sporting CP 1:0-ra nyerte meg a mérkőzést.