A 32 éves futballista a 2005–2006-os idény végén hagyta el a német bajnokcsapatot, és az utolsó pillanatban kapott ajánlatot a Santostól.
Egészen mostanáig arra lehetett számítani, hogy a Sao Paulo szerzi meg Ze Roberto játékjogát, ő azonban a Vanderlei Luxemburgo irányította riválist választotta.
A Santos a brazil bajnokság felénél a második helyen áll a tabellán.
Ze Roberto nyolc szezont húzott le a német Bundesligában, 1998-tól 2002-ig a Leverkusenben szerepelt, majd a Bayern Münchenhez szerződött.