A 31 éves középpályás 2001-ben igazolt az Atlético Mineiróból a Kaiserslauternbe, ahol a Bayern Münchenbe távozó Ciriaco Sforza utódjának szánták. A ’Lauternből 2004-ben szerződött a Schalkéhoz, ahonnan három év múlva távozott a Galatasarayhoz.
Lincoln kétéves szerződést írt alá a Palmeirasszal.