A világ- és Európa-bajnok középpályás előbb engedély nélkül vett részt orvosi vizsgálaton a Bayern Münchennél, majd nem sokkal később ötéves szerződést kötött a bajor alakulattal.
„Keressük annak a lehetőségét, hogy jogi útra tereljük az ügyet – nyilatkozta Urrutia. – Javi Martíneznek érvényes szerződése volt velünk, amelynek betartására kifejezetten nagy hangsúlyt fektet a Nemzetközi Labdarúgó-szövetség."
Mint ismert, a németek 40 millió eurós letétet helyeztek el, hogy megszerezzék a 24 esztendős játékost, aki a hétvégi, Stuttgart elleni fölényes győzelem alkalmával (6–1) mutatkozott be új csapata színeiben.